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螯合重金属离子：腐植酸钠的表面带有较大的负电性，因而可能与水中的重金属离子发生一系列反应，所以它拥有离子交换性能和与金属离子形成螯合物的能力。而腐植酸钠则具有较多羧基、酚羟基以及N-和S-结合点位的有机高分子聚合物，使腐植酸钠不仅具有酸性阳离子交换性能，而且还有络合、螯合性质。腐植酸钠对重金属离子的吸附不单是阳离子交换，而且还形成螯合关系，所以可吸附许多金属离子。
据中科院青岛海洋所介绍，在对虾育苗过程中，在育苗池内添加5 mg/L腐植酸钠，由于腐植酸钠的络合作用消除了水中重金属离子，可使对虾受精卵孵化率从40%提高到90 %，并对虾苗饲料单胞藻的生长有促进作用，接种一次即足，可使虾苗出池时间提高1-2d，从蚤状幼体到虾苗出池的成活率达80%。
决定土壤肥力的是有机—无机复合体，无机矿物质胶体一般在土壤中含量高达95%以上，对土壤基础肥料有一定影响，且不可通过人工措施改变，有机胶体即腐殖酸类物质，一般仅占有机—无机复合体的5%左右，但他却又与矿物胶体同等重要的作用，且可采取人工措施调控，施用有机肥料，使用腐殖酸类土壤改良剂和土壤改良肥料，增加土壤内腐殖质酸类含量，施腐殖酸成为土壤团粒结构形成的粘接剂，提高了土壤有机—无机复合度，增加了土壤大粒径水稳性团聚体，使土壤结构得到改善，所以说，施用腐殖酸类肥料，能有效改良各种土壤的物理结构，因此，人们称腐植酸是的土壤改良剂。
据试验小麦喷施黄腐酸，小麦叶面气孔导度比对照降低了33.7%。河南农科院研究，小麦喷施黄腐酸，不仅叶面气孔导度降低，还能使小麦气孔开张度缩小和气孔关闭，同时还为小麦提供了养分。
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