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可以说复合碘是一种比较好的杀菌剂，具有杀菌速度快、杀菌广谱、水体环境适用度宽等特点。所以，复合碘在虾蟹养殖中是除了生石灰、二氧化氯、漂白粉、聚维酮碘之外的另外一个具有很好杀菌效果的碘制剂杀菌剂。
由于复合碘对于原生动物的蛋白质都有阻碍合成的作用，所以使用后池塘中的有益菌会和其他真菌、病毒一样都会被杀灭掉。所以，在使用了复合碘之后还是需要对池塘进行重新培菌
需要注意的是复合碘的用量不能太大，按照说明书的剂量来使用，一般浓度多控制到0.1ppm。浓度超标不仅会延长碘在池塘中的活性时间，更为重要的是这样的碘制剂用量超标还会对水产有毒害作用。
复合碘还可以用于治疗细菌性或病毒性疾病，在这方面复合碘有非常等的疗效，比如一些顽固性的烂鳃，只要坚持使用复合碘半个月就会得到很好的控制，但是在使用时需要注意碘的浓度要低于50ppm，否则对鱼类有毒，而且清洗过器具的消毒水[紫药水 即2%的甲紫溶液，甲紫又称龙胆紫。]应避免直接倒入养殖鱼塘。
复合典弄到衣服上了用什么能洗掉
不耐碱，应选用中性不含酶或丝绸洗涤剂，不可使用含氯助洗剂浸泡，可用含氧助洗剂去色渍；采用挤压洗，忌拧绞，挤压除水，悬挂阴干或折半悬挂阴干，勿阳光下暴晒，不宜烘干
复合碘水产消毒时间
一般在第二次杀虫后的第二天，用复合碘溶液对整个塘口进行消毒，好的消毒时间是在阳光明媚的早晨，另外使用鳃腐康预防塘口出现烂鳃病
