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由于复合碘对于原生动物的蛋白质都有阻碍合成的作用，所以使用后池塘中的有益菌会和其他真菌、病毒一样都会被杀灭掉。所以，在使用了复合碘之后还是需要对池塘进行重新培菌
复合碘的缺点：复合碘不能杀灭芽胞等一些比较顽固的细菌，因为这些复合碘对这些细菌并没有很大的效果，而且复合碘还比较容易对光敏感，易受有机物干扰。复合碘不能用在冷水鱼等对碘敏感的鱼身上，否则可能会因为使用不当而导致大量的鱼出现死亡现象，使用时也要注意检查鱼是否对复合碘过敏。
复合碘和分析纯碘有什么区别
复合碘和纯碘区别在于二者不是一类物质，用途作用都不相同。根据查询相关资料区别如下：
刺激性不同。由于复合碘伏中含有酒精，刺激性相对于碘伏比较强，尤其是在消毒伤口或者是黏膜时，刺激性会比较大。而碘伏由于不含酒精，在擦拭涂抹伤口时一般不会刺激伤口。复合碘伏和碘伏，除了可以用于皮肤消毒以外，在做手术之前也可以对手术部位进行消毒，以及手术器械消毒等。
天津兰江鑫化供应 复合碘 络合碘 离子钙 多元有机酸 二硫氰基甲烷 聚维酮碘 苯扎溴铵等。
天津兰江鑫化技术有限公司是一家从事生产水产畜禽消毒杀菌系列、水产畜禽防病治病系列、水产养殖水质改良系列、工业冷却循环用水改良系列、医用消毒杀菌系列、城市生活污水及垃圾处理剂等环保产品开发及应用的高新企业，公司占地面积26680平方米、建筑面积9485平方米、现有职工85名、其中技术管理人员16名、科研人员12人，熟练工人57名。
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